מדרשת נשמת נוסדה בכדי לאפשר לימוד תורני גבוה לבנות מתוך אהבת תורה ויראת שמיים. המדרשה שואפת ללימוד מעמיק בכל ענפי התורה- גמרא והלכה, תנ”ך ומחשבת ישראל- כדי לפתח את האישיות מתוך עולמה של תורה. מתוך אידיאולוגיה של חיבור לעם ישראל המדרשה והבנות פועלות בשכונת פת הירושלמית אשר בתוכה שוכנת המדרשה, וכן מתקיים במרכז השבוע “בית מדרש חברתי” לגיבוש מענה תורני לנושאים ציבוריים-עכשוויים.